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新庄村清代隸屬於雲林縣斗六堡頂新庄下新庄，日據時代初期屬嘉義廳斗六支廳蔡公庵斗六堡新庄，後其屬於臺南州斗六郡古坑庄新庄。
新庄村先民早期由大陸福建省漳州府平和縣庵後壚移民來台，移住此地開墾，漸漸聚成新庄部落，並分成「頂新庄」與「下新庄」兩部落，後來因「頂新庄」地處偏遠，交通不便，常有土匪出沒，而「下新庄」交通較為便利，人口集中，生活又比「頂新庄」安全，後來「頂新庄」之先民紛紛遷至「下新庄」，因而「頂新庄」只留其名並無居民，而「下新庄」人口越來越多，台灣光復後改名為「新庄村」，目前村轄內有「新庄」、「圳頭坑」、「石仔坑」等部落。