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「登瀛書院」位於草屯鎮新庄里史館路文昌巷30號。建於清道光27年（1847），民國74年（1985）11月27日，經內政部公告指定為臺閩地區第三級古蹟。清代初期草屯為北投社之地，舊稱北投堡。其時漢人向平埔番人得耕土地，並且興修水利，至乾隆年間，草屯地方已形成了洪、李、林、簡四大姓之血緣聚落。其中之洪姓支派，開鑿「茄荖馬助圳」，聚族而居，後來成為倡建書院之登瀛社的主要成員。南北投設學最早的記錄始於清雍正12年（1734），分巡臺灣道張嗣昌為推廣教化，建議於南北二路熟番社普設土番社學，因此在南北投堡即有南投、北投兩所社學。這兩個社學是以教育歸附土番子弟為目的，其教學不僅施於番童，並兼充普通義塾，漢番混學居多。之後漢人入墾日多，到了清道光11年（1831），南投縣丞朱懋延請南北投堡、沙連堡等士紳籌建書院，作為南、北投保兩地漢人讀書的場所，此即為清道光13年（1833）建立之南投「藍田書院」。至清道光初年，西部平埔族群，在北投社番引導下陸續遷入埔里盆地，身為入埔要道之北投堡，地位益形重要。根據周璽「彰化縣志」之記載，清道光初年，北投堡文風已開，雖無文昌祠之立，但已有仕紳會文結社，以為敬業樂群之所，此即為登瀛社，「登瀛書院」即是在登瀛社員的推動下而成立。
由於「藍田書院」遠在南投，對於北投堡之學子甚感不便，因此，於清道光27年（1847）10月，莊文蔚、洪濟純等首倡，向北投堡內士紳殷戶，募款得五千八百元，創建「登瀛書院」。是年11月興工，清道光28年（1848）12月竣工，以為教學處所，並祀文昌帝君，草屯一帶文風更是大興。然雖為書院，仍不脫「義學」之性質。其經費來源除信徒捐置學田外，曾接受彰化「白沙書院」的資助，故與「白沙書院」關係密切，學規、修業有可能依循「白沙書院」。清光緒9年（1883），院舍年久失修，由李定邦、林錫爵、簡化成等人首倡，再向北投堡內仕紳募得2,300元、加上玉峰社捐資200元、碧峰社捐資100元、萃英社捐資50元，予以重修，於清光緒10年（1884）1月竣工。
「登瀛書院」於清代時期曾造就了不少人才，如舉人簡化成、武秀才洪玉麟、文秀才洪鍾英等有19名之多。日治時期，書院功能逐漸喪失，日治明治35年(1903年)因購置草鞋墩公學校用地，將三十五甲學田捐獻草鞋墩支廳，致傳統文教功能廢絕，以「文昌祠」名義存之。二戰後，歷經民國56年(1967)、民國75年(西1986)、民國77年(1988)之重修而成今日之面貌。
目前書院正殿中央供奉文昌帝君，左奉紫陽夫子朱熹、右奉魁斗星君。登瀛書院的格局是單進三合院式建築，座中為三開間正殿，兩側為七間式廂房，正殿與廂房間有過水相連。書院四週有圍牆圍繞，正面為長十三公尺的三脊燕尾照壁。基地全寬38.5公尺，縱深50公尺。書院正門、門柱皆有題聯，大廳內並存有古匾「學教敦倫」「輔翼聖教」。除此之外，其閩南花紋磚與樑上的結構，別具特色。東西廂壁上之書卷狀雕飾，也是古意盎然。
登瀛書院建築物經被評定為書院類建築物之最完整者，創建距今175年間，雖曾四次大修，然均能依照原貌加予修繕，不僅正殿之結構體毫未予更動，連兩排齋舍也不增減一間，建材之土墼(土埆)也未更換為磚塊，完整的保持初建原貌，真是一大特色，堪稱為珍貴的文化資產。