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慈德宮位於後浦頭聚落、面臨榮湖，主祀「黃府大王爺」─黃偉，為金門明代進士第二人。黃偉字孟偉，號逸叟，別號逸所，為汶水黃氏華房第五世，生於明弘治元年（1488）十月初三日，卒於明嘉靖17年（1538）三月十七日，享年51歲。黃偉性敏而誠謹，勤讀學習，於明正德五年（1510）中舉，正德九年（1514）中進士，初任南京刑部廣西司主事，後陞廣東司郎中。明嘉靖初年，應詔陳九事，黃偉為官剛正不阿，曾上「定大禮」疏、「申明舊制」疏等，又任廣東南雄知府、松江知府，所到之處無不介直敢為、受人讚仰，後歸鄉以養親講學正家為務。黃偉因不畏權勢，言人所不敢言，故仕途坎坷，然其德行風範受人景仰，故世人尊稱為「品德完人」。
據調查研究顯示，慈德宮原址在明代末年為一小廟，供俸廣澤尊王，後於擴建時挖出人骨三副，遷葬於廟左側，搭建一小廟供人祭祀，並在民國84年（1995）以石墓碑刻有「萬應公」三字。清光緒20年（1894）間金門鼠疫頻傳，後浦頭聚落鼠疫亦嚴重。在印尼經營航運業的黃卓科因母親及妻小皆因鼠疫過世，便向南洋僑民發起募捐，興建慈德宮，奉黃偉為主祀神，尊為黃府大王爺，廟內另祀有「名醫先生」及「蔡先生」，皆為祈求遏止傳染病之蔓延。興建廟宇之工匠則傳由王益順匠司設計監造、石雕部分則為二批惠安石匠對場施作。