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邱良功，字玉韞，號琢齋，後浦人。生於清乾隆34年（1769），卒於清嘉慶22年（1817）。其父邱志仁於邱良功出生後35天去世，故由母親許氏獨立撫養成人。自清乾隆56年（1791）始任金門鎮標右營右哨補伍一職，受金門鎮總兵李芳園器重。邱良功駐守海疆、圍剿中國沿海、臺灣一帶海盜，戰功卓越。清嘉慶14年（1807）出任浙江水師提督。上任後，即聯合福建水師追剿海盜蔡牽，於當年9月殲滅蔡牽與其主要黨羽。戰後，邱良功因功授賞三等男爵，並得世襲。後卒於返京述職途中，年49歲。
邱良功古厝位於金門縣金城鎮後浦城區、縣定古蹟清金門鎮總兵署西側。推測興建於清嘉慶2年（1797）或更早，應為邱良功仍為小官時所建之房舍，故建築構造簡單，形式簡樸。清嘉慶14年（1809）邱良功因掃蕩賊匪有功，官拜浙江水路提督，受封三等男爵，擬以故宅修建爵府。朝廷賜贈兩塊雕龍聖旨石，傳說係作為建爵府、定府界之聖旨石。邱府擬收購四鄰房地，惟一戶鄰人拒絕讓售，擴建府第之事只好擱置。後代在修葺故宅時，為了保存兩塊雕龍聖旨石，將其鑲砌於院內井旁牆角。建築內仍保有與邱良功相關之重要文物，具有重要歷史價值意涵。
金門縣政府於民國97年（2008）委託楊仁江建築師事務所進行「金門縣縣定古蹟邱良功古厝調查研究」，民國102年（2013）由楊仁江建築師事務所進行「金門縣縣定古蹟邱良功古厝修復工程規劃設計」，委託建華營造股份有限公司執行「金門縣縣定古蹟邱良功古厝修復工程」，民國103年（2014）竣工，完成邱良功古厝之整體修復，左大厝部分空間對民眾開放參觀，後落為所有權人居住空間，右大厝供金門傳統音樂館使用。