文化部iCulture

花蓮縣考古博物館的核心任務為保存本縣歷年遺址發掘出土之遺物，並規劃考古文物展覽推介史前文化與考古學知識予社會大眾，為確保博物館的日常運作無礙，依業務性質分工設置展示教育、典藏研究及行政營運等三組，並設館長一人，綜理全館業務。
(一) 展示教育組：展示教育組設組長1員，組員5員。本館展示主題規劃與展場設施維護與管理、教育資源服務、推廣活動規劃與執行、導覽解說培訓與觀眾服務規劃與執行、志工服務人力資源開發及推展、其他展示教育、公共服務等相關業務及其他臨時交辦事項。
(二) 典藏研究組：典藏研究組設組長1員，組員5員，專任助理2員，組織編制共8員，再依據任務、計畫需求臨時增聘臨時助理。業務分工主要負責管理、典藏本縣經由考古研究所採集、出土之遺物，包含整飭、清點、造冊，及修復館藏文物；也負責館外單位向本館借用典藏文物事宜，及其他保存相關工作。此外，本組也支援花蓮縣文化局考古相關業務，譬如提供考古遺址保存專業意見，接受文化局委託協助民眾進行工程前考古試掘，及其他文化局交辦相關事務等。
(三) 行政營運組：行政營運組設組長1員，組員5員。本館機電消防、資訊管理、採購、文書檔案收發管理、清潔管理、植栽、保全管理、場地租借、展場、典藏庫房燈光、電力及互動展示設施之維修、圖書及出版品管理、諮詢委員會、會計、出納、人事差勤、館內庶務及其他臨時交辦事項。