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虎尾涌翠閣由日治時期的虎尾郡役所主持興建，創建於昭和十四年（1939），依建築內留有之棟札紀錄推測，涌翠閣完工時間應為當年的七至九月間。創建時的虎尾郡守為田中鐵太郎，設計者為鯵坂兼行、請負人田中一松、棟樑(大木作)松原重雄。涌翠閣主要為官方接待貴賓之場所，一般大眾無法進入。
戰後初期，涌翠閣持續充任虎尾招待所使用，直至民國四十五年（1956）四月，嘉義地方法院雲林庭於虎尾成立，涌翠閣轉而成為法院職員宿舍使用。民國五十三年（1964），雲林地方法院成立，涌翠閣改作為地方法院職員宿舍之用，直至民國八十八年（1999）虎尾鎮公所收回房舍。

民國九十九年（2010）四月二日公告為「雲林縣縣定古蹟虎尾涌翠閣」
民國一百年（2011）一月完成《雲林縣縣定古蹟虎尾涌翠閣調查研究與再利用規劃》
民國一○二年二月進行「雲林縣縣定古蹟虎尾涌翠閣修復及再利用工程」；民國一○四年十月完成工程正式驗收