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梧棲真武宮主祀真武大帝（又稱玄天上帝），清道光25年（1845）由蔡大聘等6名水郊郊商，創建於當時梧棲港前，為當地信仰中心之一。廟內存有「威昭瀛嶼」匾，為戴潮春事件之見證，乃是同治3年（1864）彰化知縣王楨及守備鄭榮為叩謝玄天上帝而獻贈。

日治時期曾於昭和10年(1935)震災後重修，就整體廟宇建築而言，尚能保有原本閩南式寺廟的建築風格與形制。寺廟坐北朝南，三川殿、拜殿、正殿格局完整，然因建築基地較為狹小，拜殿延伸而與三川殿相接，至為特殊。三川殿門面尚為木作，是為硬山式建築，大木結構造型典雅，瓜筒造型優美，屬泉派之作法，線條流暢簡潔，細部裝飾樸實素淨，完全展露地方匠藝的傳統風貌。

為避開沿海強烈的東北季風，整個建築高度偏低，較一般常見的傳統廟宇建築顯得低矮，形成一特別的風格與形式。也因此真武宮日後的歷次修建無法大肆增擴，只能往右側增建，不得不多保留原貌，成為梧棲老街上少數仍保留傳統格局的古廟，此亦其古蹟價值之一。