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馬祖自1949年後壟罩於戰爭的陰霾下，實施軍政一元化治理，大量推動與興建各式戰鬥、防禦、運補、政治作戰等軍事構工。1956年起，馬祖全區進入戰地政務時期，隨處可見結構複雜的軍事建築、地下坑道及港口、據點、砲座、訓練場所、軍醫院等軍事設施，使馬祖增添許多軍事色彩。
迄至1992年11月7日，政府宣布金門與馬祖終止戰地政務的實施，讓馬祖三十六年的軍事管制和戰地政務走向盡頭。政治方面，從軍事管制過渡到地方自治：經濟方面，因逐漸撤軍而不再依賴軍人消費，而以發展觀光產業為重，並開放馬祖小三通，為活絡觀光產業的命脈。